1654年,隐元禅师应请东渡扶桑,开创日本黄檗宗,被日本皇室七次敕封、加谥国师、大师徽号,为江户时期经济社会发展作出了历史性贡献。据《普照国师年谱》记载,明泰昌元年(1620)二月十九日,隐元禅师“诣黄檗”,“礼赐紫鉴源寿公剃度”。
隐元禅师默默发愿,这次落发出家,“若不精修梵行,兴崇法门”,就会“生陷泥犁”,“自是常持疏走民间募赀”。这一年冬天,隐元禅师听说“道亨法师讲《楞严经》于海口瑞峰寺”,便“特往听之”。但是“初不解其义”,“至第四卷略有领会”。该年谱还介绍,瑞峰寺亦称“塔寺”。
二十七年后的顺治四年(1647),隐元禅师又来过一次“塔寺”。那一年,福建总督张存仁,以海滨不可测为借口,屠杀福清海口、镇东卫两城。“镇东、海口二城陷,杀者数千人”。隐元禅师“噩然伤心”,该年六月,和黄檗山首座时学禅师一起,“同谒东岳,建水陆普度者两月余。”之后,去瑞岩礼弥勒石像,“过塔寺”。
据2007年12月所立“瑞峰寺简介”碑介绍,瑞峰寺,原名妙贞观,位处人文底蕴深厚的千年古镇——海口龙山上,依山临海。据载,该寺始建于唐僖宗乾符年间(874—879)。宋徽宗宣和6年(1124),在寺内主轴线最北端建造一座七级佛塔,名为“普光万寿宝塔”。宋度宗咸淳2年(1266),改妙贞观为瑞峰寺。是年,都缘首承奉郎监镇金华王舆又慕缘重建,改名“瑞峰塔”。该塔高45米,重檐雄奇,耸入云端。后于民国2年(1913)毁于雷火,现存石构塔基、金刚柱和少量浮雕人物的石构件。1985年,华侨林绍良昆仲鼎力施助,海口九境十三墩信众捐款募集重建。
网上林文彬《隐元禅师与福清瑞峰寺的深厚法缘》一文,插有一张“瑞峰寺简介”的图片,图片上的文字讲到“1648年,隐元禅师弟子木庵禅师曾接任海口瑞峰寺住持”,这个说法值得商榷。在宗泽东澜元禄八年所刻《木庵禅师年谱》全书之中,没有这个记载。顺治五年的时候,木庵禅师38岁,他本来要去浙江天童寺参费隐通容禅师,因“路途荆塞乃止”,“即登黄檗谒隐元和尚”。木庵禅师来到黄檗山后,先是“充堂司”,第二年任黄檗山“西堂”。没有作瑞峰寺住持的记载,其分身去海口的可能性也不大。